中国畜牧兽医学会口蹄疫学分会（原称中国口蹄疫研究会）由中国畜牧兽医学会第五、六届理事长，中国农业科学院副院长程绍迥研究员组织筹备，于 1982年3月11日在甘肃省兰州市成立。本分会属中国畜牧兽医学会的分支机构，受该学会直接领导，遵照执行学会章程。

        在成立大会上经与会代表选举，产生第一届理事会由11人组成，理事长：程绍迥；副理事长：陈凌风、尹德华；秘书长：尹德华（兼）；副秘书长：王武亭。

        1991年7月理事会进行换届改选，由14人组成第二届理事会。理事长：尹德华；副理事长：韩福祥、冯静兰；秘书长：韩福祥（兼）。

        1997年10月在重庆市召开第七次学术研讨会暨会员代表大会，理事会换届，选举出第三届理事会，由26人组成。理事长：韩福祥；副理事长：刘齐、冯静兰、朱明光、邱孝高；秘书长：邱孝高（兼）。

        2003年9月在贵阳市召开第九次学术研讨会暨会员代表大会，进行换届改选，由37人组成第四届理事会。理事长：张永光；副理事长：才学鹏、黄全成、朱长光、刘湘涛、余勇、邱伯根、李玉文、李永学；秘书长：邱孝高，副秘书长：常惠芸。

        口蹄疫学分会的挂靠单位是中国农业科学院兰州兽医研究所。在该所设有秘书处，为办事机构。中国畜牧兽医学会（或分会）会员、从事畜牧兽医科研、教学、生产、防制、管理工作的科技人员及相关单位，遵守《会章》，履行义务，执行决议，均可申请参加本分会。本分会现有个人会员614人，团体会员单位40个，高级会员25人。

        本分会的主要任务是积极开展多种形式的学术活动，进行学术交流，坚持"百花齐放，百家争鸣"，实事求是的原则，围绕口蹄疫科研、生产和防制的中心任务，为政府主管部门和畜牧兽医防、检单位及会员提供技术咨询服务，协助各级政府制定防制计划及技术规范，提出合理化建议和发展策略，举办技术培训班，编辑出版有关口蹄疫的专著、刊物和会讯，介绍国内外口蹄疫疫情、科研、防制动态及进展情况，推广科研成果、先进技术和防制经验，为控制和消灭口蹄疫，加快我国畜牧兽医事业的发展做出贡献。